我國水體磷污染已十分嚴重，如何防治水體磷污染已成為我國水環境保護一個重要課題。綜合分析國內外研究資料的基礎上認為，控制河流、湖泊水體磷污染除了需要制定環境標準、加強立法管理、設立管理機構和加強水質監督管理外，主要措施還有深層曝氣、疏浚底泥控制泥磷的釋放；控制非點源磷污染負荷；種植水生植物和養魚；對點源磷污染實施工程治理限制含磷洗滌劑的使用，減少點源磷排放。
控制非點源磷污染負荷
非點源磷污染具有較分散、分布面廣的特點，控制非點源磷污染，除了合理利用土地、減少土壤侵蝕、防止水土流失外，還須有效控制地面徑流的過分漫流。挖掘滲透溝可以減少地表徑流，但對于河流和大型湖泊，由于其流域大，工程實施較困難。
種植水生植物和養魚
大量研究表明，養殖草食性魚類如白維、花縫、卿魚等不僅具有經濟價值，而且可以除掉水中大量的磷。種植水生植物如水葫蘆、鳳眼蓮等能吸收水中大量的磷，利用水生生物防治水體尤其是湖泊水體磷污染是一項值得重視的措施，但在實際應用中須考慮客觀條件的限制。
限制含磷洗滌劑的使用據報導，城市廢水中的碑有一半是來自合成洗滌荊的使用。近年來，不少發達國家對控制合成洗滌劑中磷的含量都十分重視，許多（OECD）成員國還相應地立法或制定有關法規。隨著這些國家禁磷、限磷法規的生效，無磷洗滌劑的使用已越來越廣泛。在歐洲，無磷洗滌劑的比例正穩步上升，許多國家幾乎實現了無磷化。在加拿大和日本，洗滌劑也基本上實現了無磷化，對控制水體磷污染已初見成效，推廣使用無磷洗滌劑已成為許多國家控制水體磷污染的重要途徑。
